紅豆杉是有花和果實的。它雌雄異株,球花在葉腋間單生,雄球花爲球形,有花梗,苞片呈覆瓦狀排列,有6-14枚雄蕊。雌球花沒有花梗,裏面有直立的胚珠。花期通過授粉可以結果,果實就是它的種子,呈堅果狀,當年就能成熟,外皮爲紅色。