曼地亞紅豆杉從種植開始算,要養三年才能開花,花期在春末,一般4-5月開放。由於它雌雄異株,所以花也分爲雌花和雄花,雄花呈圓球形,有花梗,基部上有覆瓦狀的苞片,還有6-14枚雄蕊。雌花造型類似,但幾乎沒有花梗,上面還有直立的胚珠。